В ходе внедрения ИСМ, наравне с ожидаемой выгодой, руководство предприятия должно в полной мере осознавать все расходы, которые понесет производство, а также трудности и возможные риски на этапе разработки и внедрения ИСМ.

Персонал должен быть морально подготовлен к долговременному процессу поэтапного внедрения. Как показывает практика, очень часто затянувшийся механизм реструктуризации компании приводит к снижению творческой активности и работоспособности, а это ведет к снижению производительности всего предприятия.

Среди мер, способствующих уменьшению негативного влияния на работу сотрудников, можно выделить проведение консультативных мероприятий для персонала с целью разъяснения целей и задач ИСМ, обеспечение благоприятных рабочих условий для персонала, выделение необходимых для внедрения ИСМ ресурсов, мониторинг и анализ действия всех членов организации и личное общение с каждым из них. Подобные меры способствуют максимально благоприятным условиям для достижения намеченных результатов.

Сертификация по международным стандартам сегодня становится стилем времени, наличие интегрированной системы менеджмента подчеркивает надежность и стабильность деятельности предприятия, а также его социальную ориентированность, ответственность и заботу о будущем.

По завершению внедрения ИСМ руководство должно осознавать, что интегрированная система менеджмента не является заменой общей системы менеджмента организации. Регулятивная область ИСМ ограничивается только тем кругом вопросов, для решения которых внедрялись ISO 9001, ISO 14001 и OHSAS 18001. Однако, это не говорит о том, что интегрированная система менеджмента не эффективна для всей организации в целом. Финансовый менеджмент, менеджмент персонала, инновационный менеджмент, менеджмент рисков, менеджмент ценных бумаг и другие структурные элементы компании по-своему регулируются в рамках каждого из описанных выше стандартов.

В процессе разработки и дальнейшего внедрения ИСМ основная роль отдается высшему менеджменту организации. Создание ИСМ - это сложный и кропотливый процесс, который может длиться многие месяцы. Однако, по достижению этого срока, предприятие получит новые мощности для развития, а руководство - новые перспективы для ведения бизнеса. Всё это возможно только в случае грамотного управления внедрением ИСМ, а не механическом выполнении требований стандартов в рамках интегрированной системы менеджмента.